新型冠状病毒不是肠道病毒。新型冠状病毒属于β属的冠状病毒，有研究显示其基因组大小约为26~32kb。
病毒的分类归属
冠状病毒科分为α、β、γ、δ四个属，新型冠状病毒归属于β属冠状病毒。而肠道病毒属于小RNA病毒科肠道病毒属，两者在病毒的分类学上属于不同的类别。
病毒的基因组特征
新型冠状病毒的基因组结构与肠道病毒有明显差异。肠道病毒基因组为单股正链RNA，长度约7.2~8.5kb，而新型冠状病毒基因组RNA为单股正链RNA，长度约26.6~27.9kb，比肠道病毒基因组长很多。
感染部位及临床特点
新型冠状病毒主要侵犯呼吸道系统，引起发热、干咳、乏力等呼吸道相关症状，严重时可导致肺炎等肺部病变。而肠道病毒主要感染肠道，可引起手足口病、疱疹性咽峡炎等疾病，临床以肠道症状（如腹泻等）或口腔、手足部位疱疹等为主要表现，与新型冠状病毒的感染部位和临床特点不同。