运动后呼吸困难的原因主要包括以下几方面：
一、氧气供应不足：剧烈运动时全身耗氧量会大幅增加，对氧气的需求明显增多。若此时全身氧气供应无法满足需求，就可能导致呼吸困难。对此，建议平时加强锻炼并坚持运动，以增强肺功能。
二、慢性阻塞性肺疾病：这是一种具有持续呼吸系统症状和气流受限特征的疾病。随着病情进展，肺组织弹性逐渐减弱，肺泡持续扩大且回缩出现障碍，残气量及残气量占肺总量百分比不断增加，从而引发肺通气功能障碍。肺气肿还会使肺血管受压，导致肺血流减少，肺通气和换气功能障碍会引起缺氧与二氧化碳潴留，进而造成呼吸困难，在运动后这种呼吸困难会进一步加重。
三、心力衰竭：在风湿性心脏病、高血压、冠状动脉粥样硬化性心脏病等基础病因下，心脏结构或功能发生改变，致使心室充盈和（或）射血功能受损，进而导致肺循环淤血、肺水肿，使气体弥散功能降低，肺泡张力增高、肺泡弹性减退，肺活量减少，这些都可引发呼吸困难。而运动时回心血量增加，左心房压力升高，会加重肺淤血，导致呼吸困难加剧。
总之，运动后呼吸困难可能是由多种原因引起的，需要根据具体情况进行分析和诊断，以便采取针对性的治疗措施。