急性胃肠炎多由饮食不洁等引起，治疗药物需根据症状选择，一般可使用止泻药、益生菌、解痉药等。比如常用的蒙脱石散是止泻药，能吸附肠道内毒素和病菌，保护肠道黏膜；益生菌如双歧杆菌四联活菌片，可调节肠道菌群。
止泻药物选择
蒙脱石散： 它能在肠道形成保护膜，吸附病原体和毒素，起到止泻作用。成人及儿童均可使用，但儿童服用时需注意剂量，按说明书或医嘱服用。黄连素片： 有一定的抑菌作用，对肠道细菌感染引起的急性胃肠炎导致的腹泻有一定疗效，成人一次一般服用 4 片左右（具体需遵医嘱）。
调节肠道菌群药物
双歧杆菌三联活菌胶囊： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和肠球菌等有益菌，能补充肠道有益菌群，调节肠道菌群平衡，改善因肠道菌群失调引起的急性胃肠炎症状，儿童可在医生指导下服用相应儿童剂型。枯草杆菌二联活菌颗粒： 适用于儿童急性胃肠炎，其中的枯草杆菌和屎肠球菌等有益菌能恢复肠道正常生态环境，抑制有害菌生长，一般用温水冲服。
解痉止痛药物
颠茄片： 能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解急性胃肠炎引起的腹痛症状。但青光眼患者禁用，孕妇及哺乳期妇女慎用，成人一般一次服用 1 - 2 片。山莨菪碱片： 也可缓解胃肠道痉挛性疼痛，常用于胃肠道绞痛。有青光眼、前列腺肥大患者禁用，儿童使用需谨慎，需在医生指导下根据体重等情况用药。
抗感染药物使用
如果是细菌感染引起的急性胃肠炎，可能需要使用抗感染药物。比如诺氟沙星胶囊，对肠道常见的革兰阴性菌有较好的抗菌作用，但 18 岁以下未成年人禁用，因为可能影响软骨发育。而对于病毒感染引起的急性胃肠炎，一般不需要使用抗感染药物，主要以对症治疗为主。