小肠套叠的治疗方式主要有非手术治疗和手术治疗。对于早期的小肠套叠，空气灌肠复位是常用的非手术治疗方法，一般在发病48小时内进行空气灌肠复位成功率较高。
非手术治疗方法
空气灌肠复位： 这是小儿小肠套叠常用的非手术治疗手段。通过肛门注入空气，利用空气的压力将套叠的肠管复位。一般要求患儿发病时间在48小时以内，全身情况良好，无明显腹胀、腹膜炎等表现时可尝试。在X线透视下可见套叠阴影逐渐后退，直至完全消失，此时表明复位成功。钡剂灌肠复位： 对于某些情况也可采用钡剂灌肠复位，但现在应用相对空气灌肠少一些。同样需要在合适的时间窗内进行，通过注入钡剂，在X线观察下使套叠的肠管复位。不过钡剂灌肠有一定风险，如钡剂误吸等，所以临床应用有一定限制。
手术治疗情况
肠切除吻合术： 当套叠时间较长，肠管发生坏死、穿孔，或者非手术治疗失败时，需要进行手术治疗。例如套叠超过48 - 72小时，肠管出现明显血运障碍，肠壁坏死、发黑，此时就需要切除坏死的肠段，然后进行肠吻合术。手术中要仔细检查肠管的情况，确保切除足够的坏死组织，以保证吻合口的良好愈合。肠外置术： 在一些病情非常严重，患儿全身状况极差，无法耐受复杂手术时，可先将坏死肠管外置，待患儿情况改善后再行二期手术。这种情况相对较少，但在病情危急时是一种挽救生命的措施。医生会根据患儿的具体病情谨慎选择手术方式，尽量减少对患儿的创伤，同时保证治疗效果。
治疗后的注意事项
密切观察病情： 无论是非手术治疗还是手术治疗后的患儿，都需要密切观察生命体征，如体温、心率、呼吸等。同时观察腹部情况，有无腹痛、腹胀复发，有无便血等情况。如果出现腹痛加剧、腹胀明显、呕吐再次出现且为血性等异常表现，要及时告知医生。饮食调整： 对于手术治疗后的患儿，肠道功能恢复需要一定时间。一般在肠道功能恢复，肛门排气排便后可开始少量进食流质饮食，如米汤等，然后逐渐过渡到半流质、普食。饮食要遵循从少到多、从稀到稠、从简单到复杂的原则，避免进食不易消化的食物，防止加重肠道负担。非手术治疗后的患儿也要注意饮食规律，避免一次性进食过多。