彻底治疗灰指甲可以通过药物治疗、手术治疗等方式。一般来说，外用抗真菌药物治疗疗程较长，可能需要数月，而口服抗真菌药物相对见效快些，但要注意药物的副作用等情况。正规的大型医院皮肤科或专业的皮肤病专科医院在灰指甲治疗方面较为可靠。
药物治疗方式
外用药物：常见的有阿莫罗芬搽剂等。使用时需先将病甲清洁、锉薄，然后涂抹药物。不过外用药物渗透甲床的能力有限，对于严重的灰指甲效果可能稍差，一般需要坚持使用3 - 6个月甚至更久。口服药物：像伊曲康唑、特比萘芬等。口服药物能从内部发挥抗真菌作用，但这类药物有一定的肝肾毒性风险，所以在服用前需要检查肝功能等指标，并且要在医生的严格监测下使用，通常疗程也需要数月。
手术治疗情况
拔甲术：过去采用拔甲的方式治疗灰指甲，但现在应用相对减少。因为拔甲创伤较大，术后恢复时间长，而且新长出的指甲仍有可能再次被真菌感染，现在更多是作为辅助治疗手段，配合药物使用。
治疗机构选择要点
大型医院皮肤科：综合性大型医院的皮肤科具有专业的医疗团队，设备齐全，能够进行准确的诊断和规范的治疗。医生经验丰富，对于灰指甲的各种情况都能进行科学判断，根据患者的具体病情制定个性化的治疗方案。专业皮肤病专科医院：这类医院专注于皮肤疾病的诊治，在灰指甲的治疗方面有更深入的研究和丰富的临床经验。医院可能有更针对性的治疗手段和先进的治疗设备，能够为患者提供更专业的灰指甲治疗服务。同时，在选择治疗机构时，还要看医院的消毒措施是否到位，避免在治疗过程中因交叉感染导致病情加重。