龟头炎的治疗药物需根据病因来选择，一般来说，细菌性龟头炎常选用抗生素类药物，如莫匹罗星软膏等；念珠菌性龟头炎可使用抗真菌药物，像克霉唑乳膏等；而对于一些特殊情况可能还会用到糖皮质激素类药物，但要谨慎使用。
细菌性龟头炎用药
莫匹罗星软膏： 这是一种局部外用的抗生素，适用于细菌感染引起的龟头炎。它能抑制细菌的生长繁殖，起到抗感染的作用。一般局部涂抹在患处即可。夫西地酸乳膏： 也是针对细菌感染的药物，对多种革兰阳性菌有较好的抗菌活性，可用于治疗细菌性龟头炎，涂抹于清洁后的龟头部位。
念珠菌性龟头炎用药
克霉唑乳膏： 属于抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用，从而治疗念珠菌感染导致的龟头炎。使用时需将药膏均匀涂抹在龟头患处。咪康唑乳膏： 同样是抗真菌药，对念珠菌有良好的抑制效果，能缓解念珠菌性龟头炎引起的瘙痒、红肿等症状，外用涂抹于龟头部位。
特殊情况的药物使用
糖皮质激素类药物： 如氢化可的松乳膏等，一般不常规使用，只有在病情较为严重且经过医生评估，排除禁忌证后才可短时间使用，因为长期使用可能会带来一些副作用，比如导致局部皮肤萎缩等。但要注意，真菌性龟头炎禁用此类药物，以免加重病情。需注意的人群： 对于儿童患者，使用这些药物时要格外谨慎，必须在医生的指导下进行，因为儿童的皮肤和身体代谢等与成人不同，药物的选择和使用剂量都需要严格把控。而孕妇如果患有龟头炎需要用药，也一定要咨询医生，根据具体情况选择合适的、对胎儿影响较小的药物。