眼睛里长肉球样东西的原因包括真菌感染、霰粒肿、结膜结石、用眼过度等。具体如下：
一、真菌感染：
1.如果平时不注意眼睛卫生，常用带细菌的手去揉眼睛，就容易引发炎症、红肿甚至长出肉球样的东西。
2.治疗方法包括去正规医院检查，滴眼药水，同时注意合理用眼以防止疲劳等。
二、霰粒肿：
1.睑板腺排出管道阻塞，分泌物滞留，可能形成霰粒肿，即睑板腺囊肿，通常不痛不痒，翻开眼皮内侧呈暗红色。
2.治疗方法有，一般较小的睑板腺囊肿可自行吸收，也可能缓慢增大，可通过按摩或热敷促进其吸收消散，较大的睑板腺囊肿则需进行手术摘除，这属于眼科常规手术，不必紧张。
三、结膜结石：
1.若眼皮内表面结膜存在细胞代谢产物或脂肪堆积，就可能形成结膜结石。
2.治疗方法是最好先到医院检查，确诊后可在表面麻醉下将结石取出，随后滴眼药水。
四、用眼过度：
1.可能因上火、劳累过度、用眼过度以及缺乏户外运动等导致，频繁揉眼会引起充血，原本正常的地方有个叫泪阜的小凸起。
2.治疗建议是保证充足睡眠，放松心情，保持眼部清洁，不要频繁揉眼，多喝水，通过热敷和按摩来缓解眼部不适症状，若暂时无异常症状可先继续观察。
总之，当发现眼睛里长了肉球样东西时，应及时明确原因，并根据具体情况采取相应的治疗措施。