头皮毛囊炎的治疗需综合多方面因素，一般来说，可通过局部用药、全身用药以及日常护理等来改善。局部用药方面，像莫匹罗星软膏就较为常用，它能抑制细菌生长，帮助缓解炎症，通常连续使用几天可见一定效果。
局部药物治疗
外用抗生素软膏： 比如夫西地酸乳膏，它对引起头皮毛囊炎的常见细菌有抑制作用，可直接涂抹在患处，每天使用2 - 3次。酮康唑洗剂： 它具有抗真菌和抑制油脂分泌的作用，每周使用2 - 3次，能帮助清洁头皮，减少毛囊炎的发生几率。
全身药物治疗
抗生素口服： 如果毛囊炎比较严重，出现大面积感染、红肿疼痛明显等情况，可能需要口服抗生素，如头孢类抗生素。但使用这类药物需要注意，必须在医生指导下使用，因为要避免滥用导致耐药性。抗真菌药物口服： 当头皮毛囊炎是由真菌感染引起时，可能需要口服抗真菌药物，像伊曲康唑，但儿童和孕妇等特殊人群使用需格外谨慎，必须遵医嘱。
日常护理要点
头皮清洁： 要保持头皮清洁，但也不能过度清洗，建议每天用温和的洗发水清洗头皮，不过清洗频率不宜过高，2 - 3天一次较为合适。生活习惯： 要注意规律作息，保证充足睡眠，一般成年人每天需要7 - 8小时的睡眠时间。同时要避免吃辛辣、油腻的食物，这类食物可能会加重头皮油脂分泌，从而诱发或加重毛囊炎。避免刺激： 不要用手搔抓头皮，以免抓破皮肤引起感染加重。另外，尽量避免使用刺激性强的发胶、染发剂等美发产品，减少对头皮的刺激。