头皮毛囊炎的最佳治疗方法需综合多方面因素，一般来说，可通过局部治疗、全身治疗等方式来改善。通常局部治疗是基础，若病情较重可能需要结合全身用药。
局部治疗方法
清洁头皮：
使用温和洗剂：可以选择含有酮康唑成分的洗剂，每周使用2 - 3次，能帮助清洁头皮，抑制真菌等病原体的生长。比如康王洗剂，它对头皮的马拉色菌有一定的抑制作用，有助于改善头皮毛囊炎的症状。
外用药物涂抹：
抗生素类药膏：如果是细菌感染引起的头皮毛囊炎，可以外用莫匹罗星软膏。它能针对金黄色葡萄球菌等常见的细菌起到杀菌消炎的作用。涂抹时要注意清洁头皮后，薄薄地涂在患处，一天可以涂抹2 - 3次。抗真菌类药膏：要是由真菌感染导致的头皮毛囊炎，像酮康唑乳膏就比较适用。它可以抑制真菌的生长繁殖，一般每天涂抹1 - 2次，坚持使用一段时间能看到效果。
全身治疗情况
细菌感染严重时：
口服抗生素：当头皮毛囊炎症状较为严重，局部治疗效果不佳，或者伴有发热等全身症状时，可能需要口服抗生素。例如头孢类抗生素，不过具体使用哪种抗生素需要医生根据病情来判断。一般来说，口服抗生素需要按照医生的嘱咐按时服用，通常要连续服用数天，比如3 - 7天不等，具体时间取决于病情的恢复情况。
真菌感染顽固时：
口服抗真菌药物：如果是真菌感染引起的头皮毛囊炎且比较顽固，可能需要口服抗真菌药物，如伊曲康唑。但口服抗真菌药物需要严格遵循医生的指导，因为这类药物可能会对肝脏等有一定影响，医生会根据患者的肝功能等情况来决定是否使用以及使用的剂量和疗程。
生活方式调整
保持头皮清洁干燥：
洗头频率适度：不要过于频繁洗头，也不要长时间不洗头。一般建议油性头发的人可以2 - 3天洗一次头，干性头发的人可以3 - 5天洗一次头。洗头时要注意用温水，避免水温过高刺激头皮。
注意饮食：
避免辛辣油腻食物：尽量少吃辛辣、油腻的食物，比如辣椒、油炸食品等，这些食物可能会加重头皮油脂分泌，从而加重头皮毛囊炎的症状。可以多吃一些新鲜的蔬菜和水果，如苹果、香蕉、菠菜、西兰花等，补充维生素等营养物质，有助于头皮的健康。
避免搔抓头皮：
防止感染扩散：要尽量避免用手搔抓头皮，因为手上有很多细菌，搔抓可能会导致头皮破损，使炎症加重，还可能引起感染扩散到更多的部位。如果头皮瘙痒，可以通过轻轻拍打头皮来缓解。