小孩感冒高烧39℃时，应及时就医明确病因，根据具体情况采取物理治疗、药物治疗等帮助退热和治疗感冒。具体如下：
一、一般治疗：
1.多喝水：让小孩多喝温水，可促进排汗、排尿，有助于加速退热。
2.贴退热贴：能起到一定的降温作用。
3.温水擦拭身体或泡温水澡：通过蒸发散热，有利于小孩退热。
4.注意保暖：避免小孩再次着凉。
二、药物治疗：
1.退烧药选择：若物理治疗效果不佳，(1)2-6个月小孩可选择对乙酰氨基酚退烧；(2)超过6个月小孩可口服布洛芬，口服困难或伴有明显呕吐时，可用布洛芬栓或对乙酰氨基酚栓肛门给药。
2.抗病毒治疗：若小孩是病毒感染，(1)可给予抗病毒口服液、蓝芩口服液等进行抗病毒治疗；(2)若是流感病毒，需选择奥司他韦颗粒。
3.抗生素应用：若小孩为细菌感染，需及时应用抗生素，如阿莫西林、头孢克肟等。
总之，小孩感冒高烧39℃时要重视，通过多种方法来帮助小孩缓解症状和治疗疾病。