肺脓肿主要是由多种病原体引起的肺部组织化脓性病变。通常是由于病原体感染肺部，导致肺部组织发生坏死、液化形成脓肿。比如，有数据显示，吸入性肺脓肿较为常见，约占肺脓肿的一半左右。
病原体感染因素
细菌感染： 常见的致病菌有金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、链球菌等。例如金黄色葡萄球菌感染，它可以通过呼吸道进入肺部，在肺部大量繁殖，引发肺部组织的炎症反应，进而导致肺脓肿形成。肺炎克雷伯杆菌感染也较为常见，这种细菌毒力较强，容易引起肺部组织的坏死和脓肿形成。厌氧菌感染： 口腔中的厌氧菌是导致肺脓肿的重要原因之一。当人体抵抗力下降时，口腔中的厌氧菌可经吸入进入肺部，从而引发肺脓肿。比如长期饮酒、口腔卫生状况差的人，更容易发生厌氧菌感染引起的肺脓肿。
气道阻塞因素
异物阻塞： 如果气道内进入异物，如瓜子、花生米等，会导致气道部分或完全阻塞，使远端的肺部组织引流不畅，容易引发感染，进而形成肺脓肿。儿童由于好奇心强，误吸异物的情况相对较多，所以儿童肺脓肿中因异物阻塞气道导致的情况并不少见。肿瘤阻塞： 支气管肺癌等肿瘤也可能阻塞气道，导致远端肺部组织分泌物引流受阻，继发感染形成肺脓肿。随着年龄增长，肿瘤的发生率增加，所以中老年人中因肿瘤阻塞气道引发肺脓肿的情况也时有发生。
免疫力低下因素
基础疾病影响： 患有糖尿病、艾滋病等基础疾病的人，免疫力相对较低，容易受到各种病原体的侵袭，从而增加肺脓肿的发病风险。例如糖尿病患者，高血糖环境有利于细菌的生长繁殖，且自身免疫力下降，肺部感染后更容易发展为肺脓肿。艾滋病患者由于免疫系统严重受损，对病原体的抵御能力极差，发生肺脓肿的几率明显高于正常人。长期使用免疫抑制剂： 长期接受糖皮质激素等免疫抑制剂治疗的患者，机体免疫力受到抑制，肺部容易受到病原体感染，进而引发肺脓肿。比如一些自身免疫性疾病患者需要长期使用免疫抑制剂，在用药过程中若发生肺部感染，就较易发展为肺脓肿。