稽留流产是指胚胎或胎儿已死亡滞留在宫腔内未能及时自然排出的情况，其发生原因较为复杂，主要有以下几方面。首先，胚胎染色体异常是导致稽留流产的常见原因之一，大约50% - 60%的稽留流产与胚胎染色体异常有关，比如染色体数目异常（如三体、单体等）或结构异常。
染色体因素：
胚胎自身染色体问题： 受精卵在形成过程中，如果染色体发生了畸变，就很容易出现稽留流产。这种情况是胚胎自身发育出现了差错，属于比较常见的原因。父母染色体异常遗传： 父母双方如果有一方存在染色体平衡易位等异常情况，有可能遗传给胚胎，从而增加稽留流产的发生风险。
母体因素：
内分泌失调： 比如黄体功能不全，女性体内的孕激素对于维持妊娠至关重要，黄体功能不全时，孕激素分泌不足，就无法很好地支持胚胎发育，容易引发稽留流产。另外，甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能减退还是亢进，都会影响体内的激素平衡，进而影响胚胎的正常发育，增加稽留流产几率。全身性疾病： 孕妇如果患有严重的感染性疾病，像严重的肺炎、败血症等，病原体产生的毒素以及炎症反应可能会影响胎盘和胚胎的血供，导致胚胎死亡。还有一些慢性疾病，如糖尿病、高血压等，如果病情控制不佳，也会影响胎盘循环，使得胚胎发育受阻，引发稽留流产。
免疫因素：
自身免疫异常： 孕妇自身的免疫系统出现异常，产生了攻击胚胎的自身抗体，就会破坏胚胎的正常着床和发育，导致稽留流产。例如抗磷脂抗体综合征，体内的抗磷脂抗体可引起胎盘血管血栓形成，影响胎盘供血，使胚胎得不到充足的营养供应而死亡。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫耐受不足，不能很好地接受胚胎作为“异物”，从而产生免疫排斥反应，导致胚胎停止发育，发生稽留流产。
环境因素：
化学物质接触： 孕妇长时间接触一些有毒的化学物质，像苯、甲醛等，这些化学物质可能会影响胚胎的正常发育，增加稽留流产的发生风险。比如在一些化工厂工作，长期接触相关化学制剂的孕妇，稽留流产的可能性相对较高。放射性物质暴露： 如果孕妇接触了过量的放射性物质，如在放射科工作且没有做好防护措施，放射性辐射会对胚胎的细胞造成损伤，干扰胚胎的正常分裂和发育，容易引发稽留流产。