稽留流产指胚胎或胎儿已死亡滞留宫腔内未能及时自然排出者，造成稽留流产的原因较多，约50% - 60%与胚胎染色体异常有关。
染色体异常因素
胚胎自身染色体问题： 受精卵在形成过程中，由于各种原因导致染色体数目或结构异常，这是早期稽留流产最常见的原因之一。比如在细胞分裂过程中，受到辐射、化学物质等影响，染色体发生畸变，使得胚胎无法正常发育，最终导致稽留流产。父母染色体异常遗传： 若父母双方有一方存在染色体平衡易位等异常情况，有可能遗传给胚胎，从而影响胚胎的正常发育，增加稽留流产的发生风险。
母体因素影响
内分泌失调： 女性体内的内分泌激素对维持妊娠至关重要。例如，黄体功能不全时，黄体分泌的孕激素不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，容易导致稽留流产。甲状腺功能减退也会影响胚胎的生长发育，因为甲状腺激素参与了胚胎的代谢等多种生理过程，甲状腺功能异常时会干扰胚胎正常发育进程。全身性疾病： 孕妇患有某些全身性疾病也可能引发稽留流产。像严重的糖尿病未得到良好控制时，高血糖环境会影响胚胎的生长；感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒等，病毒可通过胎盘影响胚胎，导致胚胎死亡进而发生稽留流产。
子宫解剖结构异常
子宫畸形： 常见的子宫畸形有单角子宫、双角子宫等。子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育空间，使得胚胎难以正常生长，增加稽留流产的几率。比如单角子宫，子宫腔相对较窄小，胚胎发育受限。宫腔粘连： 多次人工流产、刮宫等宫腔操作可能导致宫腔粘连，宫腔粘连会使宫腔容积减小，影响胚胎的着床和营养供应，从而引发稽留流产。
免疫因素干扰
自身免疫异常： 孕妇自身免疫系统出现异常，产生抗磷脂抗体等自身抗体，这些抗体可影响胎盘的血管，导致胎盘血管栓塞，胎盘血供不足，进而影响胚胎的发育，引发稽留流产。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫耐受不足，母体免疫系统将胚胎视为外来物进行攻击，使得胚胎无法在子宫内正常存活，导致稽留流产。