宝宝高烧40℃且3天不退烧，需及时采取以下措施：
一、尽快带宝宝去医院儿科就诊，进行血液化验及影像学检查，以便明确发烧原因，进而实施针对性治疗，同时要配合进行物理降温。
1.物理降温注意事项：
(1)宝宝发烧时，不要给宝宝穿过多衣服、盖厚被，防止不利于散热。
(2)要让宝宝多喝水，这样既能避免脱水，又有助于散热。
(3)可采用温水擦浴来降低宝宝体温。
(4)也可将冰袋用毛巾包裹后放置在宝宝腋下、腹股沟等大血管流经处以降低体温，但需注意时间不能过长，每20分钟要更换一下部位。
二、可在医生指导下服用对乙酰氨基酚、布洛芬等药物进行退热处理，同时要警惕高热惊厥的发生。
1.根据感染类型用药：
(1)如果是细菌或病毒感染导致的高热，可遵医嘱加用抗炎和抗病毒的药物。
(2)如果为支原体感染，则要使用大环内酯类药物进行治疗。
(3)若为特殊疾病导致，则需依据检查结果，积极治疗原发病。
总之，当宝宝出现高烧不退的情况时，要高度重视，及时采取有效的应对措施，以保障宝宝的健康。