儿童扁桃体肥大的治疗需根据具体情况选择，一般来说，轻度扁桃体肥大可先观察，中重度可能需要药物或手术干预。
观察等待情况
对于一些轻度的扁桃体肥大，若没有明显的临床症状，比如不影响呼吸、吞咽，也没有反复的扁桃体发炎等情况，可以选择观察等待。但要注意让孩子保持良好的生活习惯，比如保证充足的睡眠，一般学龄儿童每天需要保证10小时左右的睡眠；饮食上要营养均衡，多吃蔬菜水果等。不过需要定期带孩子到医院复查，观察扁桃体肥大的变化情况。
药物治疗情况
抗生素使用：
如果扁桃体肥大是由细菌感染引起的反复发炎，可能需要使用抗生素。常用的抗生素有青霉素类，如阿莫西林等。但使用抗生素要在医生的指导下，根据孩子的年龄、体重等因素来选择合适的剂量和疗程。一般来说，疗程可能需要7 - 10天左右。不过要注意，不能自行滥用抗生素，以免导致细菌耐药等问题。
局部药物使用：
可以使用一些局部的喷雾或含漱液来缓解症状。比如一些具有消炎消肿作用的含漱液，像氯己定含漱液等，但是使用含漱液时要注意，年龄较小的孩子可能不太配合，需要家长协助操作，并且要按照正确的方法使用，一般每次含漱时间不宜过长，几秒钟即可。
手术治疗情况
手术指征：
当扁桃体肥大非常严重，已经影响到孩子的呼吸，出现睡眠打鼾、呼吸暂停等情况；或者扁桃体反复发炎，一年发作超过7 - 8次，经过保守治疗效果不佳时，可能需要考虑手术治疗。手术一般采用扁桃体切除术，现在多采用微创的手术方式，对孩子的创伤相对较小。
术后注意事项：
手术后孩子需要注意休息，前几天饮食要以温凉的流质或半流质食物为主，比如牛奶、藕粉、粥等，避免吃辛辣、刺激性的食物，以免刺激手术创面。同时要注意口腔卫生，按照医生的要求进行口腔护理，防止伤口感染等并发症的发生。一般术后1 - 2周伤口会逐渐恢复。