女性雌激素偏低可能由多种因素引起，如年龄增长、卵巢功能异常、内分泌疾病等。
年龄增长因素
随着年龄增加，女性卵巢功能逐渐衰退，卵泡数量减少，雌激素分泌量会自然降低，一般在围绝经期（通常45 - 55岁）较为明显，这是机体自然衰老过程中激素变化的体现。
卵巢功能异常因素
卵巢是分泌雌激素的主要器官，若卵巢发生病变，像卵巢早衰（多在40岁前出现卵巢功能减退），会直接影响雌激素的合成与分泌；卵巢手术切除部分或全部卵巢组织，也会导致雌激素分泌不足。
内分泌疾病因素
一些内分泌疾病会干扰雌激素的正常分泌，例如垂体疾病，垂体分泌的促性腺激素等异常，会影响卵巢功能进而使雌激素偏低；甲状腺功能异常，甲状腺激素分泌异常也可能波及雌激素的代谢和分泌平衡。
生活方式因素
长期不良生活方式也可能导致雌激素偏低，如长期熬夜会打乱内分泌节律，影响激素分泌；过度节食使身体营养摄入不足，尤其是蛋白质、脂肪等营养物质缺乏，会影响雌激素的合成原料，从而导致雌激素水平下降。