感染新型肺炎的确诊标准主要依据病原学检查等。一般来说，新型冠状病毒核酸检测阳性是确诊的重要依据。
核酸检测方面
实时荧光RT - PCR检测： 在鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物、血液、粪便等标本中实时荧光RT - PCR检测新型冠状病毒核酸阳性可确诊。病毒基因测序： 与已知的新型冠状病毒高度同源者也可确诊。
影像学及临床表现辅助判断
临床表现： 患者多有发热、干咳、乏力等表现，部分患者还可出现鼻塞、流涕、咽痛、肌痛和腹泻等症状。胸部影像学： 早期呈现多发小斑片影及间质改变，以肺外带明显。进而发展为双肺多发磨玻璃影、浸润影，严重者可出现肺实变，胸腔积液少见。但影像学表现需结合核酸检测等综合判断，不能单独依据影像学确诊。
排查其他类似疾病
要注意与流感病毒、副流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、冠状病毒等其他已知病毒性肺炎及肺炎支原体感染等鉴别。通过详细询问流行病学史，如是否有疫情高发地区居住史、旅行史，是否接触过确诊病例等，综合各方面情况来准确判断是否感染新型肺炎并确诊。