新冠肺炎肺炎确诊标准主要依据病原学及血清学等检查来判定。通常采用实时荧光RT-PCR检测鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物、血液、粪便等标本中的新型冠状病毒核酸，若核酸检测呈阳性即可确诊；另外，采集急性期和恢复期双份血清，检测新型冠状病毒特异性IgG和IgM抗体，恢复期血清特异性IgG抗体滴度比急性期呈4倍及以上升高，也可确诊。
病原学检查方面
核酸检测： 采用实时荧光RT-PCR方法，在鼻咽拭子、痰等标本中检测新型冠状病毒核酸。一般来说，当标本中检测到新型冠状病毒的特定核酸序列时，就有较大的确诊依据。例如，在患者的呼吸道标本中通过规范的核酸检测流程，一旦出现阳性结果，结合临床症状等综合判断，可考虑确诊。基因测序： 对病毒进行基因测序也是确诊的重要手段。如果病毒的基因序列与已知的新型冠状病毒基因序列高度同源，也能明确诊断为新冠肺炎。
血清学检查方面
特异性IgM抗体： 感染新型冠状病毒后，人体免疫系统会产生特异性IgM抗体，一般在感染后的3 - 5天左右开始出现。通过血清学检测发现特异性IgM抗体阳性，结合临床情况可以作为早期诊断的参考依据之一。特异性IgG抗体： 特异性IgG抗体出现相对较晚，但持续时间较长。急性期特异性IgG抗体阳性，恢复期抗体滴度较急性期有4倍及以上升高，这种情况也能确诊新冠肺炎。比如，患者急性期检测IgG抗体为阴性或低滴度阳性，恢复期再次检测IgG抗体滴度明显升高，就符合确诊条件。
结合临床症状等综合判断
患者通常会有发热、干咳、乏力等临床表现，部分患者还可能出现嗅觉、味觉减退或丧失，鼻塞、流涕、咽痛、结膜炎、肌痛和腹泻等症状。在有上述临床症状的基础上，再结合病原学或血清学的相关检查结果，就能更准确地确诊新冠肺炎。例如，一个患者出现发热、干咳等症状，同时核酸检测呈阳性，那么基本可以确诊为新冠肺炎患者。