同卵双胞胎和异卵双胞胎在多个方面存在区别。首先，同卵双胞胎是由一个受精卵在早期分裂成两个胚胎发育而成，其基因几乎完全相同，在人群中约占双胞胎的1/3；而异卵双胞胎是由两个不同的卵子分别与两个不同的精子结合形成两个受精卵发育而来，基因相似度和普通兄弟姐妹相似，约占双胞胎的2/3。
形成原理不同
同卵双胞胎： 一个受精卵在发育初期，由于某种原因一分为二，形成两个独立的胚胎。这两个胚胎拥有完全相同的遗传物质，所以性别、外貌等特征几乎一模一样。比如在一些基因研究中发现，同卵双胞胎的DNA相似度高达99.9%以上。异卵双胞胎： 女性卵巢同时排出两个卵子，并且这两个卵子分别与不同的精子结合，形成两个受精卵。这两个受精卵各自发育成独立的胚胎，它们的遗传物质有差异，所以性别可能相同也可能不同，外貌等特征的相似程度和普通兄弟姐妹一样。
外貌特征表现
同卵双胞胎： 因为基因完全相同，所以外貌、身高、体型等外在特征非常相似。比如他们的面部轮廓、头发颜色和质地、眼睛颜色等都几乎一样。即使后天生活环境有差异，外貌上的相似性依然很明显。异卵双胞胎： 由于基因有差异，外貌特征的相似程度和普通兄弟姐妹类似。可能性别不同，外貌上也会有明显区别，比如一个可能像父亲多一些，另一个像母亲多一些。
健康状况关联
同卵双胞胎： 因为基因相同，所以在一些遗传性疾病的易感性上非常相似。如果其中一个患有某种与基因相关的疾病，另一个患病的概率相对较高。例如，如果同卵双胞胎中的一个患有某种遗传性的皮肤病，另一个患病的可能性比异卵双胞胎之间患病的可能性要大很多。异卵双胞胎： 由于基因差异，他们在遗传性疾病易感性上和普通兄弟姐妹一样，没有特别紧密的关联。一个患病，另一个患病的概率和普通人群中随机患病的概率差不多。