滑膜囊肿通常难以自愈。滑膜囊肿是由滑膜炎引发的疾病，而滑膜炎本身属于无菌性炎症，是因局部液体积聚导致。针对滑膜囊肿，可依据症状轻重选择不同治疗方法，主要有保守治疗和手术治疗。
一、保守治疗：
1.对于处于早期、囊肿直径较小且局部症状不明显的患者，可采用保守治疗。即让局部制动休息，在关节周围佩戴支具以保护关节，限制其活动，从而减轻滑膜炎症。
2.还可进行局部热敷。
3.配合药物治疗，常见药物如布洛芬、塞来昔布等非甾体类消炎止痛药，也可涂抹红花油、扶他林等骨科常用的活血化瘀药物，这类软膏对滑膜囊肿的消除有较好效果。
二、手术治疗：
对于直径较大、已存在一定时间且对局部关节活动有影响的滑膜囊肿，可采用手术治疗。通过手术能将滑膜囊肿的囊壁完整切除，并清除积液，以达到治愈目的。
总之，滑膜囊肿早期病例可采用制动休息、热敷、药物治疗等保守方式，若保守治疗效果不佳，或囊肿直径较大对局部外观、关节活动功能产生影响，则可通过手术方式进行根治。