尿后疼痛主要原因有以下几类情况。首先，泌尿系统感染是常见原因之一，比如急性膀胱炎，女性发病率相对较高，约占泌尿系统感染的60%左右。女性由于尿道短而直，细菌容易逆行感染。患者除了尿后疼痛，还可能伴有尿频、尿急等症状。
泌尿系统感染相关
膀胱炎：除了急性膀胱炎，还有慢性膀胱炎，慢性膀胱炎病程较长，容易反复发作。患者尿后疼痛可能时轻时重，还可能出现下腹部隐痛等表现。尿道炎：分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。淋菌性尿道炎主要通过性接触传播，由淋病奈瑟菌感染引起，发病较急，尿后疼痛明显，尿道口还可能有脓性分泌物。非淋菌性尿道炎多由衣原体、支原体感染所致，症状相对淋菌性尿道炎稍轻，但也会有尿后疼痛、尿道瘙痒等症状。
泌尿系统结石
尿道结石：多来自于上尿路的结石排入尿道，患者会有尿线变细、排尿困难，同时伴有尿后疼痛，疼痛程度可能较为剧烈。膀胱结石：主要症状是排尿中断和尿后疼痛，改变体位后可能恢复排尿。
其他情况
前列腺炎：多见于成年男性，分为急性前列腺炎和慢性前列腺炎。急性前列腺炎起病急，会出现尿频、尿急、尿后疼痛，还可能伴有发热、寒战等全身症状；慢性前列腺炎则表现为尿后或便后尿道有白色分泌物溢出，尿后疼痛反复出现，病程较长。尿道损伤：多有外伤史，比如骑跨伤等，损伤后会出现尿后疼痛，还可能有血尿等表现。