肚脐眼上面疼可能由多种原因引起，比如胃肠道疾病，像胃炎就比较常见，据统计，约有10% - 20%的人会在一生中经历胃炎相关不适。
胃肠道疾病导致
胃炎：多种因素可引发胃炎，比如长期饮食不规律，经常暴饮暴食、过度节食或者吃太多辛辣、油腻、刺激性食物，就容易刺激胃黏膜，出现肚脐眼上面疼的情况。另外，幽门螺杆菌感染也是引发胃炎的重要原因之一。胃溃疡：胃溃疡患者也常出现肚脐眼上面疼痛，疼痛具有一定规律性，一般是进食后疼痛，大约1 - 2小时后缓解，然后下次进食又可能重复这个过程。
胆囊及胆道问题
胆囊炎：胆囊发生炎症时，也可能导致肚脐眼上面疼，尤其是在进食油腻食物后，疼痛可能会加重。胆囊炎急性发作时，疼痛还可能放射到右侧肩背部。胆结石：胆结石移动时可能堵塞胆管，引起肚脐眼上面及右上腹疼痛，疼痛程度往往比较剧烈，有时还会伴有恶心、呕吐等症状。
胰腺疾病
胰腺炎：急性胰腺炎发作时，患者会出现肚脐眼上面偏左的疼痛，疼痛较为剧烈，还可能伴有腹胀、恶心、呕吐等症状，严重的胰腺炎可能会危及生命。慢性胰腺炎也会有反复发作的上腹部疼痛，疼痛部位多在肚脐眼上面。