病理诊断不明确、判断疾病预后、预测治疗效果等情况要做免疫组化。免疫组化运用免疫学基本原理，即抗原与抗体特异性结合，通过化学反应让标记抗体的显色剂显色，从而确定组织细胞内抗原，并对其进行定位、定性及相对定量研究。
一、病理诊断不明确
普通的HE切片染色无法给出明确病理诊断，且需要与其他疾病进行诊断与鉴别诊断时，就需进行免疫组化。这是因为在病理科中，取到活检后病理切片会先在显微镜下制片并做初步观察，通常只是依据不同染色观察形态，但很多不同病变仅靠形态难以区分和鉴别，此时进一步加做免疫组化能对初步检验进行深化判断。
二、判断疾病预后
通过免疫组化对预后判断有重要意义。其可从分子诊断层面判断肿瘤性质，明确是良性还是恶性，还能对肿瘤类型进行详细分型，为后续治疗提供有力依据。
三、预测治疗效果
借助免疫组化可初步判断患者化疗和分子靶向药物的适用范围，为更精准检测提供筛检依据。
总之，免疫组化在病理诊断、疾病预后判断以及治疗效果预测等方面都有着重要作用。