肺部血栓的治疗方法需根据具体情况选择，一般来说，治疗方式包括药物治疗、手术治疗等。对于急性肺血栓栓塞症，常用的药物有抗凝药物，像普通肝素通常在住院期间开始使用，通过静脉给药，能迅速发挥抗凝作用来阻止血栓进一步形成和扩大，一般需要持续使用数天；低分子肝素也较为常用，皮下注射即可，相对普通肝素使用更方便，可在门诊使用。
药物治疗方面
抗凝药物作用：抗凝药物的主要作用是防止血栓继续进展和新血栓形成，为身体自身的纤溶系统溶解血栓创造条件。常用的抗凝药物除了普通肝素和低分子肝素，还有华法林，不过华法林起效相对较慢，用药初期需要监测国际标准化比值（INR）来调整剂量，使其维持在合适范围。溶栓药物情况：对于高危的肺血栓栓塞症患者，可能会使用溶栓药物，比如尿激酶等。溶栓药物可以快速溶解已形成的血栓，但使用溶栓药物有一定风险，比如出血风险增加，所以需要严格掌握适应证。
手术治疗情况
肺动脉血栓摘除术：这是一种比较激进的手术方式，适用于病情非常严重、经积极内科治疗无效的患者。手术风险相对较大，因为涉及到肺动脉部位的操作。经皮导管介入治疗：包括导管溶栓、碎栓、取栓等操作。例如导管溶栓是通过导管将溶栓药物直接输送到血栓部位，提高局部药物浓度，增强溶栓效果；碎栓和取栓则是通过导管器械将血栓破碎或取出，改善肺动脉血流。这种治疗方式创伤相对较小，但也有一定的操作风险。
康复与后续管理
康复训练：在病情稳定后，患者可以进行适当的康复训练，比如逐渐增加活动量，从床边活动开始，慢慢过渡到室内行走等。一般建议在医生指导下逐步进行，以提高心肺功能。长期抗凝管理：如果患者需要长期抗凝治疗，像对于一些易栓症患者等情况，需要长期服用抗凝药物，并且要定期监测凝血功能等指标，根据指标调整抗凝药物剂量，同时要注意观察有无出血等不良反应，比如牙龈出血、皮肤瘀斑等情况，一旦出现要及时就医。