细菌性结膜炎首选的治疗药物通常是抗生素类药物，比如左氧氟沙星滴眼液，一般用药后数小时到1-2天内症状会有所改善。
常用抗生素药物选择
喹诺酮类滴眼液： 像氧氟沙星滴眼液就是常用的，它通过抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制来发挥杀菌作用，对多种引起细菌性结膜炎的病菌都有较好的抑制效果。磺胺类滴眼液： 磺胺醋酰钠滴眼液也可用于细菌性结膜炎的治疗，它能抑制细菌叶酸的合成，从而抑制细菌生长繁殖。
不同人群的注意事项
儿童患者： 儿童使用抗生素类滴眼液时要格外小心，比如左氧氟沙星滴眼液，18岁以下儿童一般不建议首选使用，除非没有其他更合适的药物且在医生严格评估下使用。孕妇患者： 孕妇患细菌性结膜炎时，选择药物需谨慎，一些抗生素可能会对胎儿产生影响，应在医生指导下选择相对安全的药物，像某些磺胺类滴眼液在孕妇中的使用需要医生权衡利弊后决定。
非药物辅助措施
眼部清洁： 可以用生理盐水清洗眼睛，一般每天清洗1-2次，能清除眼部分泌物，减轻炎症刺激，帮助缓解细菌性结膜炎的症状。不过清洗时要注意动作轻柔，避免损伤眼部。避免交叉感染： 患者要注意个人卫生，不要用手揉眼睛，毛巾、手帕等物品要单独使用，并且定期消毒，避免与他人共用洗漱用品，防止将病菌传染给他人，也能防止自身再次感染。
用药后的观察要点
症状改善情况： 使用抗生素药物后要观察症状是否有改善，一般用药后1-2天内，眼部分泌物增多、眼睛红肿、疼痛等症状应该逐渐减轻。如果用药3天左右症状没有明显缓解甚至加重，如眼睛红肿更厉害、分泌物增多且变稠等，要及时复诊，考虑是否需要调整治疗方案。药物不良反应： 还要留意是否出现药物不良反应，比如使用氧氟沙星滴眼液后是否有眼部刺激感、瘙痒感等不适，如果出现较为明显的不良反应，也需要告知医生进行处理。