乳腺囊肿的形成原因较多，主要与内分泌紊乱、哺乳障碍以及乳腺结构不良等因素有关。内分泌紊乱方面，女性体内雌激素水平异常升高时，可能影响乳腺组织的正常代谢，促使乳腺导管扩张、上皮增生，进而增加乳腺囊肿形成风险。比如，一些长期精神压力大、作息不规律的女性，内分泌容易失调，乳腺囊肿发生率相对会高些。
内分泌因素：
激素失衡影响： 雌激素和孕激素的失衡是常见原因。当体内雌激素水平相对过高，而孕激素水平相对不足时，会刺激乳腺导管上皮增生，使导管扩张形成囊肿。像育龄期女性在月经周期中，若激素波动较大，就容易出现这种情况。长期服用激素类药物： 长期服用含雌激素的药物，会干扰体内正常的激素平衡，增加乳腺囊肿发生几率。例如因疾病长期服用雌激素类药物的患者，需密切关注乳腺情况。
哺乳相关因素：
乳汁排出不畅： 哺乳期女性若存在乳腺导管堵塞，乳汁无法顺利排出，就会在乳腺内积聚形成囊肿。比如初产妇哺乳经验不足，乳腺导管容易堵塞，就可能引发乳腺囊肿。断奶不当： 突然断奶，乳腺内的乳汁不能及时被吸收，也可能导致乳汁潴留形成囊肿。所以断奶应逐渐进行，让乳腺有一个适应过程。
乳腺结构不良因素：
乳腺组织增生与退化异常： 乳腺的正常结构在增生和退化过程中出现异常，会使乳腺导管和小叶发生结构改变，进而形成囊肿。这种情况在一些乳腺组织本身存在轻微结构不良的女性中较为常见。年龄因素影响： 随着年龄增长，乳腺组织的结构和功能会发生变化，中老年女性相对更易出现因乳腺结构不良导致的乳腺囊肿。一般40 - 50岁左右的女性要特别留意乳腺健康状况。