中枢神经系统感染包含多种疾病。其中，病毒性脑炎较为常见，约占中枢神经系统感染性疾病的10% - 20%。
病毒性脑炎
单纯疱疹病毒性脑炎：由单纯疱疹病毒引起，可导致发热、头痛、癫痫发作等，病情严重时可能出现意识障碍。肠道病毒性脑炎：多由柯萨奇病毒、埃可病毒等引起，常见于儿童，一般病程相对较短，但也可能出现神经系统症状。
细菌性脑膜炎
肺炎链球菌脑膜炎：是儿童和成人细菌性脑膜炎的常见类型之一，常继发于肺炎等感染性疾病，起病较急，有高热、头痛、颈项强直等表现。脑膜炎奈瑟菌脑膜炎：也就是流脑，具有传染性，可通过飞沫传播，儿童易感染，发病急骤，会出现高热、皮肤瘀点瘀斑等症状。
真菌性中枢神经系统感染
新型隐球菌脑膜炎：较为常见，多见于免疫功能低下者，如艾滋病患者等，起病缓慢，有头痛、低热等表现，病情逐渐加重。曲霉菌性中枢神经系统感染：相对少见，多发生在严重免疫抑制的患者身上，感染途径多样，可累及中枢神经系统。
寄生虫性中枢神经系统感染
脑囊虫病：是由于猪肉绦虫幼虫寄生于中枢神经系统引起，与卫生习惯有关，可出现癫痫、头痛、颅内压增高等症状。脑型疟疾：由疟原虫感染引起，在疟疾流行地区较为常见，患者有发热、头痛、抽搐等表现，严重时可危及生命。