滤泡性咽炎的治疗方法需根据病情等情况综合判断，一般可通过药物治疗、物理治疗等方式改善。通常药物治疗中常用含漱液，如复方硼砂含漱液等，可清洁口腔，减轻炎症。
药物治疗方面
局部含服药物： 可以使用碘含片等，碘含片能缓慢释放出碘，有杀菌、抗感染的作用，帮助减轻咽部的炎症反应。中成药： 比如金嗓利咽丸，它具有疏肝理气、化痰利咽的功效，对滤泡性咽炎有一定的缓解作用，能改善咽部异物感等不适症状。
物理治疗手段
激光治疗： 对于咽部滤泡较明显且药物治疗效果不佳的情况，可考虑激光治疗。一般治疗时会利用激光的能量破坏滤泡组织，从而减轻咽部的滤泡增生情况，但治疗后要注意保持口腔清洁，避免感染。冷冻治疗： 也是一种物理治疗方式，通过低温使滤泡组织坏死、脱落，进而达到治疗滤泡性咽炎的目的。不过冷冻治疗后可能会有短暂的咽部不适，通常会逐渐缓解。
生活方式调整
饮食方面： 要避免食用辛辣、刺激性食物，像辣椒、花椒等，这些食物容易刺激咽部，加重滤泡性咽炎的症状。同时要多喝水，每天保证饮水量在1500 - 2000毫升左右，保持咽部黏膜湿润。避免过度用嗓： 比如长时间大声说话、唱歌等，过度用嗓会使咽部负担加重，不利于滤泡性咽炎的恢复。要注意让咽部适当休息，合理用嗓。