新生儿甲状腺功能低下主要通过补充甲状腺激素来治疗，通常需要长期用药。一般从确诊后就应立即开始治疗，比如在出生后2-4周内就需启动治疗。
用药选择
左甲状腺素钠： 是治疗新生儿甲状腺功能低下的常用药物，它能补充体内缺乏的甲状腺激素，维持正常的生理功能。通过模拟人体自身分泌的甲状腺激素发挥作用，帮助新生儿的生长发育和代谢维持正常。
治疗时间
长期治疗： 新生儿甲状腺功能低下通常需要终身服用左甲状腺素钠进行替代治疗。要定期监测甲状腺功能，根据检查结果调整药物剂量，一般每1-2个月需要复查甲状腺功能，根据TSH（促甲状腺激素）和甲状腺激素水平来调整左甲状腺素钠的用量，以保证甲状腺功能维持在正常范围。
监测要点
定期检查： 除了监测甲状腺功能外，还需要监测新生儿的生长发育情况，包括身高、体重、智力发育等方面。一般每3个月需要评估一次生长发育指标，确保药物治疗能促进新生儿正常生长。同时，要注意观察新生儿是否有嗜睡、反应迟钝、喂养困难等甲状腺功能低下相关的表现，如有异常需及时就医调整治疗方案。
特殊注意事项
个体差异： 每个新生儿对左甲状腺素钠的反应可能存在个体差异。有些新生儿可能需要较小的剂量就能使甲状腺功能恢复正常，而有些可能需要根据情况逐步调整剂量。所以要密切关注新生儿用药后的身体反应，根据具体情况进行个性化调整。而且在用药过程中，要避免与某些食物或药物同时服用，比如大豆蛋白、含铁或钙的药物等可能会影响左甲状腺素钠的吸收，一般建议在喂奶前1小时或喂奶后2-3小时服用左甲状腺素钠，以保证药物的有效吸收。