根据上述需求，以下是关于脚趾上长硬疙瘩并伴有疼痛的可能原因、诊断方法和治疗建议：
1.鸡眼：长期挤压和摩擦可能导致脚趾上出现硬疙瘩，并伴有疼痛。疙瘩通常呈圆锥形，表面光滑，淡黄色或深黄色，境界清楚，稍隆起，中央有倒圆锥状角质栓嵌入真皮。鸡眼好发于足跖前中部第3跖骨头处、砪趾胫侧缘，也见于小趾及第2趾趾背或趾间等突出及易受摩擦的部位。可通过鸡眼贴、水杨酸软膏等药物，或鸡眼挖除术进行治疗。
2.跖疣：由人乳头瘤病毒感染引起，可通过直接或间接接触传播。初起为细小发亮的丘疹，逐渐增大至黄豆大小或更大，因为受压而形成淡黄色或褐黄色胼胝样斑块或扁平丘疹，表面粗糙，界限清楚，边缘绕以稍高的角质环。常对称发生于足底、足跟、跖骨头或趾间受压处。可通过冷冻、电灼、刮除等物理方法，或使用干扰素、咪喹莫特等药物进行治疗。
3.胼胝：长期机械刺激或压迫导致皮肤角质层增厚，好发于掌跖，与职业有关。损害为蜡黄色、扁平或稍隆起的局限性角质肥厚性斑块，质硬而稍透明，边界不清，中央较厚、边缘较薄。无明显自觉症状，或有轻度压痛。可通过减少摩擦和压迫，外用角质促成剂或角质松解剂等方法进行治疗。
4.痛风石：痛风患者在耳廓、跖趾、指间、掌指等关节处，出现黄白色赘生物，大小不一，可大可小，质地偏硬，称为痛风石。痛风石是痛风的特征性临床表现之一，也是痛风病情进展的结果。可通过药物降尿酸，或手术剔除痛风石进行治疗。
5.其他：脚趾上长硬疙瘩并伴有疼痛还可能是其他原因引起的，如肿瘤、感染等。建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。