食管炎的药物治疗需根据具体类型和病情来选择，常见用于食管炎的药物有抑酸剂等。一般来说，质子泵抑制剂是治疗食管炎常用的抑酸药物之一。
抑酸药物
质子泵抑制剂：这类药物能有效抑制胃酸分泌，比如奥美拉唑，它可以通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而减轻胃酸对食管黏膜的刺激，常用于反流性食管炎的治疗。H₂受体拮抗剂：像雷尼替丁，能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌，对轻至中度食管炎有一定的治疗作用，但抑酸效果相对质子泵抑制剂稍弱。
促胃肠动力药物
多潘立酮：可以促进胃肠道蠕动，加快胃排空，减少胃内容物反流至食管，从而缓解食管炎症状。它能增强食管蠕动和下食管括约肌张力，促进胃排空，一般适用于轻度反流性食管炎患者。莫沙必利：也是一种促胃肠动力药，通过兴奋胃肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5 - HT₄受体，促进乙酰胆碱释放，增强胃肠道动力，改善食管蠕动功能，促进胃排空，对反流性食管炎有一定的治疗作用。
黏膜保护剂
硫糖铝：在食管黏膜表面形成保护屏障，阻止胃酸、胃蛋白酶等对黏膜的侵袭，有助于受损食管黏膜的修复。它能与溃疡或炎症处的蛋白质结合，形成保护膜，同时还能刺激前列腺素E合成和表皮生长因子分泌，促进黏膜再生。铝碳酸镁：不仅能中和胃酸，还能吸附胆汁，对食管黏膜有保护作用，可缓解食管炎引起的烧心、反酸等症状。它可以迅速中和胃酸，并保持较长时间，同时吸附胆汁酸等物质，减轻对食管黏膜的损伤。
针对特殊类型食管炎的药物
感染性食管炎：如果是真菌性食管炎，可能需要使用抗真菌药物，如氟康唑等。氟康唑是一种广谱抗真菌药，能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，从而发挥抗真菌作用。而细菌性食管炎相对较少见，若发生可能需要根据细菌培养及药敏试验结果选用合适的抗生素进行治疗。