葡萄胎的发生主要与受精卵异常有关。一般来说，完全性葡萄胎染色体核型多为双倍体，均来自父系，常见是空卵受精；部分性葡萄胎染色体核型通常是三倍体。
营养因素相关情况
缺乏维生素A及前体胡萝卜素和动物脂肪：有研究表明，当女性体内缺乏维生素A及其前体胡萝卜素以及动物脂肪时，发生葡萄胎的风险可能会增加。比如一些长期素食且饮食中严重缺乏这类营养物质的女性，相对更容易出现葡萄胎情况。胡萝卜素摄入不足：如果女性日常饮食中胡萝卜素摄入量过少，也可能对胎盘的正常发育产生影响，进而增加葡萄胎发生的几率。像那些几乎不吃富含胡萝卜素食物，如胡萝卜、南瓜等的女性，患病风险相对较高。
染色体异常方面
完全性葡萄胎染色体情况：完全性葡萄胎的染色体核型多数为46XX，是由一个细胞核基因物质缺失或失活的空卵与一个单倍体精子（23X）受精，随后精子的染色体发生复制而成为二倍体（46XX）；少数为46XY，是由一个空卵与两个单倍体精子（23X和23Y）受精所致。部分性葡萄胎染色体情况：部分性葡萄胎的染色体核型通常是三倍体，最常见的核型是69XXY，是由于一个正常卵子与两个精子受精，或者是一个正常精子与减数分裂失败的异常卵子受精所导致。
内分泌失调影响
激素水平失衡：女性体内的绒毛膜促性腺激素（hCG）、雌激素等激素水平异常对葡萄胎的发生有重要影响。例如，当体内hCG分泌异常增多，且雌激素水平显著高于正常妊娠时，就可能干扰胎盘的正常发育，增加葡萄胎发生的可能性。在正常妊娠中，hCG会有规律地上升，而葡萄胎患者体内hCG水平会异常升高且持续不降。卵巢功能状态：卵巢功能如果出现异常，比如黄体功能不足等情况，会影响孕激素的分泌，进而影响子宫蜕膜的正常转化，不利于胚胎的正常着床和发育，从而增加葡萄胎发生风险。比如一些患有多囊卵巢综合征等影响卵巢功能疾病的女性，相对更易出现葡萄胎。