怀孕的前3个月（即妊娠早期）胎儿容易畸形。这一时期是胚胎各器官分化形成的关键阶段，细胞分裂迅速，对外界因素非常敏感。
胚胎发育关键期的风险
受精后3-8周： 这个时间段是胚胎器官形成的重要时期，比如心脏、大脑、四肢等重要器官都在这个阶段开始分化。如果此时受到不良因素影响，像孕妇感染病毒、接触有毒有害物质等，就容易导致胎儿器官发育异常，出现畸形。例如，孕妇感染风疹病毒，可能会使胎儿患上先天性心脏病、白内障等多种畸形。孕早期其他风险因素： 孕妇服用某些致畸药物也会增加胎儿畸形风险。像抗肿瘤药物、某些抗生素等，在孕早期使用可能会干扰胎儿正常发育。另外，孕妇自身的一些疾病，如糖尿病控制不佳，也会影响胎儿发育，增加畸形发生几率。
孕中期的相对风险情况
孕中期胎儿畸形的发生概率相对孕早期低一些，但仍需关注。不过如果孕妇在孕中期接触放射性物质，比如接受了不必要的X线检查，也可能对胎儿造成影响。还有孕妇营养不良，缺乏叶酸等重要营养素，也可能影响胎儿神经系统等的发育，虽然不像孕早期那样极易导致严重畸形，但也会有一定不良影响。
孕晚期胎儿畸形的特点
孕晚期胎儿畸形相对较少，但也不是完全没有。如果孕妇在孕晚期发生严重的妊娠并发症，如妊娠高血压综合征严重到一定程度，可能会影响胎儿的血液供应，导致胎儿生长受限等情况，虽然这不是传统意义上的结构畸形，但也属于胎儿发育异常的一种情况。另外，若孕妇有不良生活习惯持续到孕晚期，比如继续大量吸烟、饮酒，也可能对胎儿的器官功能等产生不利影响。