阴茎变短可能由内分泌系统异常、肥胖以及阴茎硬结症等因素导致。具体如下：
一、内分泌系统异常
1.阴茎的发育很大程度上依赖于性激素和生长激素。如果体内内分泌系统出现异常，生长激素和雄激素分泌不足，会使海绵体适度收缩，进而对男性阴茎的发育产生影响，造成阴茎缩短。
二、肥胖原因
1.对于那些在青春期发育前就一直肥胖的患者，很可能会对阴茎发育形成阻碍，最终导致阴茎出现缩小的情况。
三、阴茎硬结症
1.会引发白膜纤维样硬结，使得阴茎勃起时发生变形，给人阴茎不能伸直从而感觉变短的印象。
针对这些情况的治疗方法如下：
一、内分泌系统异常
1.一般可以遵循医生的建议使用六味地黄丸、谷维素片、逍遥丸等药物进行改善。
二、肥胖原因
1.通常可以按照医生的指导先着手控制体重，通过减肥来进行调控。
三、阴茎硬结症
1.可以根据医生的建议使用左卡尼汀口服溶液、维生素E软胶囊等药物进行治疗。
总结：阴茎变短可能涉及多种原因，包括内分泌系统异常、肥胖和阴茎硬结症等，应根据具体病因采取相应的治疗措施。