脑萎缩是由多种原因引起的，比如衰老因素，随着年龄增长，65岁以上老年人中脑萎缩的发生率约为6.3%。
衰老相关因素
自然衰老： 人体进入中老年后，脑部组织会逐渐出现生理性萎缩，这是一种随着年龄增长而发生的正常生理变化过程，脑细胞会慢慢减少，脑体积也会慢慢变小。慢性疾病影响： 像高血压，长期高血压会使脑血管承受过高压力，影响脑部血液循环，久而久之容易导致脑萎缩。据统计，有高血压病史且病程较长的人群，脑萎缩的发病风险比无高血压人群高约2 - 3倍；还有糖尿病，高血糖会损伤脑血管和神经细胞，影响脑部代谢，增加脑萎缩发生几率。
脑部疾病因素
脑血管疾病： 脑梗死就是常见的一种，脑部血管被堵塞后，相应脑组织得不到血液供应，会发生缺血性坏死，进而引发脑萎缩。比如大面积脑梗死患者，后续发生脑萎缩的可能性较大；脑出血也会造成脑萎缩，脑出血会破坏脑部正常结构，血肿周围的脑组织会因为缺血、水肿等出现损伤，慢慢导致脑萎缩。神经系统退行性疾病： 阿尔茨海默病是典型的神经系统退行性疾病，患者脑部会出现进行性萎缩，尤其是海马体等与记忆相关的区域萎缩明显，病情会逐渐导致认知功能减退、记忆力下降等严重问题；帕金森病也可能引发脑萎缩，该病会影响脑部多巴胺能神经元，长期发展也会出现脑部不同程度的萎缩情况。
其他因素
外伤因素： 严重的头部外伤，如车祸导致的重型颅脑损伤，头部受到剧烈撞击后，脑部组织会遭受损伤，可能会引起脑萎缩。尤其是外伤后出现长期昏迷、脑部有明显挫伤等情况的患者，发生脑萎缩的风险更高；脑部手术后，由于手术对脑部组织的影响，也可能导致脑萎缩，比如一些脑部肿瘤切除手术后，部分患者会出现不同程度的脑萎缩。不良生活方式： 长期大量饮酒也是一个因素，酒精会损害脑细胞，影响脑部的正常代谢和功能，长期饮酒者比不饮酒者患脑萎缩的概率要高。有研究表明，酗酒10年以上的人群，脑萎缩发生率比正常人群高出40%左右；还有长期营养不良，缺乏某些重要营养素，像B族维生素等，会影响脑部神经细胞的正常代谢，也可能增加脑萎缩发生的可能性。