克罗恩病目前缺乏特效治疗方法，主要是防治并发症及防止肠道损毁。常见治疗手段包括药物治疗和手术治疗。
一、药物治疗
1.轻度克罗恩病的治疗：
结肠型、回肠型和回结肠型克罗恩病患者，氨基水杨酸制剂可作为首选。
病变局限于回肠末端、回盲部或升结肠的患者，可优先考虑布地奈德局部用药。若这些治疗均无效，则按照中度活动期克罗恩病来处理。
2.中度克罗恩病的治疗：
激素仍是首要选择药物。
病变局限于回盲部的，可考虑应用布地奈德。
当激素抵抗或依赖时，推荐加用硫嘌呤类药物或甲氨蝶呤。
对激素抵抗、依赖，且对硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等免疫抑制治疗无效或不能耐受者，推荐使用英夫利西单抗治疗。
3.重度克罗恩病的治疗：
静脉用糖皮质激素是重度克罗恩病的首选治疗方式。激素无效时，可应用英夫利西单抗，也可一开始就直接应用。
4.特殊部位克罗恩病的治疗：
此类预后不良，需早期积极治疗。中重度患者宜尽早应用硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤、甲氨蝶呤等免疫抑制剂和（或）英夫利西单抗。
轻度患者可首选全肠内营养治疗。
食管、胃、十二指肠克罗恩病可单独存在或与其他部位克罗恩病同时存在，不同的是质子泵抑制剂对此类有治疗效果。
二、手术治疗
当患者出现并发症或内科治疗无效时，可进行病变肠管切除术。外科手术的时机应依据患者具体病情来确定，以避免盲目无效治疗而延误手术时机并增加手术风险。
总之，对于克罗恩病的治疗，需根据病情的不同程度和具体部位选择合适的治疗方法，同时要把握好手术时机，以尽可能改善患者病情。