儿童扁桃体切除可能会对孩子的免疫功能等方面产生一定影响。一般来说，儿童的扁桃体在6岁前是重要的免疫器官，切除后短期内可能使上呼吸道感染的风险略有增加，但随着年龄增长，其他免疫器官会逐渐代偿。
对免疫功能的影响
短期影响： 扁桃体是人体免疫系统的一部分，儿童时期尤其是6岁以下，扁桃体参与机体的细胞免疫和体液免疫。切除后，短期内可能让孩子上呼吸道感染的几率稍有上升，不过这种情况通常不会太严重。比如有研究发现，部分儿童在扁桃体切除后的3 - 6个月内，上呼吸道感染频率可能比未切除的孩子略高，但大多是轻微的感冒症状。长期代偿： 随着孩子年龄增长，身体的其他免疫器官会逐渐承担起部分免疫功能。一般到12岁左右，身体的免疫代偿基本完成，这时候上呼吸道感染的频率会逐渐接近扁桃体未切除的孩子。
对日常呼吸吞咽的影响
术后初期吞咽不适： 扁桃体切除术后1 - 2天内，孩子吞咽时可能会有疼痛，需要吃软食或者流食。比如术后1 - 2天可以给孩子吃牛奶、米粥等温和的食物，减轻吞咽时的刺激。不过这种吞咽不适一般会在1 - 2周内逐渐缓解。呼吸方面的变化： 正常情况下扁桃体不会明显影响呼吸，但如果是扁桃体过度肥大影响呼吸的孩子，切除后呼吸会变得更顺畅。不过少数孩子可能在术后初期因为伤口肿胀等情况，有短暂的呼吸轻度不适，但很快就会恢复正常。
对生活质量的影响
恢复后的正常生活： 扁桃体切除后恢复良好的孩子，生活质量会逐渐恢复如常。比如可以正常参加体育活动、饮食也能恢复正常。一般术后1个月左右，孩子就可以像以前一样正常生活学习，只是术后初期需要注意避免剧烈运动和刺激性食物。特殊情况的注意： 个别孩子可能在扁桃体切除后，因为心理因素初期会有一些不适应，但大多数孩子都能很快适应。家长要多关注孩子的心理状态，给予鼓励和支持，帮助孩子顺利度过恢复阶段。