内分泌六项检查一般在月经来潮后的第2-5天（卵泡早期）检查最合适准确，这个时间段属于基础内分泌，能反映卵巢的基本功能状态。此时通过测定性激素水平，可以了解女性内分泌的基础状态，比如判断卵巢储备功能等情况。
月经周期不同阶段的影响
卵泡早期（月经第2-5天）： 在月经周期的卵泡早期，体内的雌激素、孕激素等处于相对较低的水平，此时检测内分泌六项能较为准确地反映卵巢的基础功能。比如可以通过促卵泡生成素（FSH）、促黄体生成素（LH）等指标来评估卵巢的储备能力。一般来说，这个时期的激素水平相对稳定，能较好地反映身体基础的内分泌状况。排卵期： 如果是想了解排卵相关的内分泌情况，可在预计排卵日附近进行检测。但相对来说，卵泡早期的检测应用更为广泛，因为它能更全面地反映卵巢的基础内分泌水平。不过对于月经不规律的女性，可能需要根据具体情况来判断合适的检查时间，必要时可能需要多次检测来综合评估。
特殊情况的检查时间
闭经女性： 如果女性出现闭经情况，随时都可以检查内分泌六项，这时候不受月经周期的限制。因为闭经的女性体内激素水平可能已经发生了明显变化，随时检测都能获取相关的内分泌信息，帮助医生判断闭经的原因，比如是由于内分泌失调导致的闭经，还是其他疾病引起的闭经等。长期不来月经且急于了解结果的女性： 对于长期不来月经又很想尽快知道内分泌情况的女性，也可以随时去检查，不需要刻意等到某个特定时间。不过医生会根据检查结果结合临床症状来综合分析病情。
检查前的注意事项
空腹抽血： 一般建议在检查前保持空腹状态，空腹时间通常为8-12小时。因为饮食可能会影响某些激素的水平，比如进食后可能会使血糖、血脂等发生变化，进而间接影响内分泌激素的测定结果。所以为了保证检查结果的准确性，最好在检查前保持空腹，然后前往医院进行抽血检查。避免剧烈运动： 在检查前一天要注意避免剧烈运动，因为剧烈运动可能会影响激素的分泌。检查当天要保持平静的状态，不要有过于激动、紧张等情绪，以免影响内分泌六项的检查结果。