女性HPV初期通常没有明显症状，约70%-80%的女性感染HPV后，在1年内可依靠自身免疫力将病毒清除，无需特殊治疗。
皮肤黏膜表现相关情况
寻常疣表现：HPV感染皮肤时，可能出现黄豆大小的丘疹，表面粗糙，摸起来发硬，形状多呈圆形，颜色与正常皮肤相近或偏灰。好发于手部，比如手指、手背等部位。扁平疣表现：一般是米粒至绿豆大小的扁平丘疹，表面光滑，颜色多为浅褐色或正常肤色，常多发，密集分布，好发于面部、手背、前臂等部位。
生殖器部位表现相关情况
低危型HPV引发的病变：若感染低危型HPV，可能在生殖器部位出现尖锐湿疣。初期可能是细小淡红色丘疹，逐渐增大增多，表面凹凸不平，呈乳头样、菜花状或鸡冠样，质地柔软，有的会有分泌物，伴有瘙痒等不适，好发于大小阴唇、阴道口、会阴、肛周等部位。高危型HPV持续感染风险：高危型HPV持续感染可能暂时没有明显局部症状，但长期持续感染可能会引发宫颈病变等，不过这也需要通过进一步检查才能明确。
其他可能伴随情况
免疫低下者表现：如果女性自身免疫力较低，感染HPV后可能恢复时间较长，而且可能更容易出现病毒持续感染的情况，相对而言身体可能会有更易疲劳等非特异表现，但这不是特异性的HPV初期表现。心理方面影响：部分女性得知感染HPV后可能会出现焦虑情绪，不过这不属于身体症状，但也是需要关注的方面，因为心理状态也可能影响身体的免疫状态等。