生化流产指的是精卵结合后，没有成功在子宫着床的妊娠。导致生化流产的原因较多，其中约50%-60%的生化流产与胚胎染色体异常有关，这是自然淘汰的过程。
母体因素导致
内分泌异常： 女性体内的激素水平对维持妊娠至关重要。例如，黄体功能不全是常见原因之一，黄体分泌的孕酮不足，无法为胚胎着床和发育提供良好的子宫内环境，大约有20%-30%的生化流产与此相关。甲状腺功能异常也会有影响，甲状腺功能减退或亢进都会干扰妊娠的正常进程。子宫因素： 子宫的形态和结构异常会阻碍胚胎着床。像子宫畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会使子宫腔的形态发生改变，影响胚胎着床。另外，子宫内膜息肉、子宫肌瘤等病变也可能影响胚胎着床，据统计，有子宫病变的女性发生生化流产的风险比正常女性高。
免疫因素影响
自身免疫异常： 母体自身的免疫系统可能会错误地攻击胚胎，导致生化流产。例如，存在抗磷脂抗体综合征，体内产生的抗磷脂抗体可引起血管内皮损伤，影响胎盘的血液供应，从而干扰胚胎发育，这类因素导致的生化流产约占10%-20%。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫耐受不足也会引发问题。母体和胚胎之间的免疫平衡被打破，使得母体的免疫系统对胚胎产生排斥反应，进而导致生化流产。
外界因素作用
环境因素： 过多接触某些有害的化学物质，如苯、甲醛等，或者受到辐射影响，都可能增加生化流产的几率。另外，女性在怀孕早期如果吸烟、酗酒，烟草中的尼古丁和酒精都会对胚胎发育产生不良影响，增加生化流产发生的可能性。生活方式： 过度劳累、精神压力过大等也可能影响内分泌和身体的内环境，从而诱发生化流产。长期处于高压力状态下的女性，身体的应激反应会干扰激素的正常分泌，不利于胚胎着床和发育。