生化流产是指精卵结合后，没有成功在子宫着床的妊娠。导致生化流产的原因有多种，其中胚胎因素是常见原因之一，大约50% - 60%的生化流产是因为胚胎染色体异常，比如染色体数目异常（多一条或少一条染色体等）或者结构异常，这些异常会使胚胎发育不良，难以着床。
母体因素影响
内分泌因素： 女性体内的激素水平对妊娠至关重要。例如，黄体功能不全时，卵巢排卵后形成的黄体分泌孕激素不足，子宫内膜不能很好地转化为适合受精卵着床的状态，就容易导致生化流产。一般来说，黄体期孕激素水平低于正常范围就可能存在问题。另外，甲状腺功能异常也会影响生化妊娠，甲状腺功能减退或亢进都可能干扰胚胎的着床和发育。免疫因素： 自身免疫异常也可能引发生化流产。比如存在抗磷脂抗体综合征，体内的抗磷脂抗体可与胎盘滋养细胞结合，影响胎盘的血供，阻碍胚胎的正常发育，从而导致生化流产。还有母胎免疫调节失衡，母体免疫系统对胚胎产生排斥反应，也会使受精卵难以着床。
子宫因素相关
子宫解剖结构异常： 子宫畸形是常见的原因之一，像纵隔子宫、双角子宫等，子宫的形态异常会影响受精卵的着床位置和着床环境。另外，子宫内膜息肉、子宫肌瘤等也可能干扰受精卵着床。例如，较大的子宫内膜息肉可能会占据宫腔空间，影响受精卵着床；黏膜下子宫肌瘤会改变宫腔内环境，不利于胚胎着床。
其他因素影响
生活方式因素： 不良的生活方式也可能导致生化流产。长期吸烟的女性，香烟中的尼古丁等有害物质会影响卵子和精子的质量，还会影响子宫内膜的容受性，增加生化流产的风险。过度饮酒同样对生殖系统有损害，酒精会干扰激素平衡和胚胎发育过程。还有长期处于压力过大的状态，会使身体内分泌失调，影响生殖相关的激素分泌，进而影响受孕和胚胎着床，增加生化流产的可能性。