肾病综合征的引发原因较多，其中原发性肾病综合征可能与自身免疫紊乱有关，比如约30%的微小病变型肾病综合征患者可能与T淋巴细胞功能紊乱相关。而继发性肾病综合征的常见原因有：
感染因素导致
细菌感染： 如链球菌感染后肾炎，可在感染后1-3周出现肾病综合征表现。病毒感染： 乙肝病毒相关的肾炎也较为常见，据统计，约有一部分肾病综合征患者是由乙肝病毒感染引发的，乙肝病毒可以通过免疫复合物沉积等机制损伤肾脏导致肾病综合征。
系统性疾病相关
狼疮性肾炎： 多见于育龄女性，患者除了有肾病综合征的表现，还会有皮肤红斑、关节疼痛等系统性红斑狼疮的其他症状。因为自身免疫系统错误攻击自身组织，累及肾脏引发肾病综合征。糖尿病肾病： 糖尿病病程较长的患者，如病程10年以上的糖尿病患者中，有一定比例会出现糖尿病肾病，进而发展为肾病综合征，主要是因为长期高血糖导致肾脏微血管病变。
药物或中毒因素
某些药物： 如含金制剂、青霉胺等药物，可能会引起机体的免疫反应，损伤肾脏导致肾病综合征。不过这种情况相对较少见，但在有用药史的患者中需要考虑。中毒因素： 接触某些毒物，如蜂蛰、蛇毒等，也可能引发肾脏的免疫炎症反应，从而导致肾病综合征。