过敏性鼻炎和鼻窦炎症状有明显区别。一般来说，过敏性鼻炎的典型症状多在接触过敏原后较短时间内出现，而鼻窦炎症状持续时间相对较长。
症状表现部位
过敏性鼻炎：主要症状集中在鼻部，表现为鼻痒、打喷嚏（多为连续打喷嚏，次数可达数次到数十次）、流清水样鼻涕等。鼻窦炎：症状涉及部位更广，除了鼻部症状外，还可能影响头部，出现头痛等症状，且头痛有一定规律性，比如急性上颌窦炎常表现为前额部疼痛，晨起轻，午后重；急性额窦炎是晨起头痛逐渐加重，午后减轻，晚间消失。
症状持续时间
过敏性鼻炎：如果脱离过敏原，症状可能在数分钟至数小时内缓解。例如，接触花粉后引发的过敏性鼻炎，一旦远离花粉环境，打喷嚏、流清涕等症状可能很快得到改善。鼻窦炎：症状持续时间较长，急性鼻窦炎一般病程<12周，如果急性鼻窦炎治疗不彻底等可能转为慢性鼻窦炎，病程>12周，症状会反复出现，如鼻塞、流脓涕等症状会持续较长时间不消失。
鼻涕特点
过敏性鼻炎：流的是清水样鼻涕，量较多。鼻窦炎：鼻涕多为脓性或黏脓性，颜色发黄或发绿，比如慢性鼻窦炎患者常流黏脓性鼻涕，有时还会有臭味。
伴随症状
过敏性鼻炎：常伴有眼痒、流泪、咽痒等眼部和咽喉部的症状，部分患者可能伴有哮喘发作，尤其是在过敏季节时，哮喘症状可能会因过敏性鼻炎发作而加重。鼻窦炎：除了鼻部和头痛症状外，可能伴有嗅觉减退，患者会感觉闻不到气味或者闻到的气味不清晰。严重时还可能出现全身症状，如发热、乏力等，尤其是急性鼻窦炎患者，全身症状相对较明显。