肺心病目前尚无法完全通过药物治愈，但可以通过药物缓解症状、控制病情进展。常用的药物有以下几类：
改善通气的药物
氨茶碱类药物：可以松弛支气管平滑肌，改善通气。比如氨茶碱，能增加膈肌收缩力，有利于改善通气功能，但使用时要注意个体差异，部分人可能会出现胃肠道不适等反应。β₂受体激动剂：像沙丁胺醇气雾剂，能快速舒张支气管，缓解喘息症状。不过这类药物不宜长期单一使用，否则可能会产生耐药性。
减轻心脏负荷的药物
利尿剂：氢氯噻嗪是常用的利尿剂，通过排钠排水减轻心脏前负荷。但使用时要注意监测血钾，长期使用可能会导致低钾血症，需要适当补充钾盐。螺内酯也是一种保钾利尿剂，与氢氯噻嗪联合使用，既能利尿又能防止血钾过低。血管扩张剂：硝酸酯类药物如硝酸甘油，能扩张静脉和动脉，降低心脏前后负荷。但使用时要密切关注血压变化，避免血压过度下降。
控制感染的药物
抗生素：根据感染的病原体不同选用不同的抗生素。如果是细菌感染，常用的有青霉素类，如阿莫西林；头孢菌素类，如头孢拉定等。医生会根据痰培养和药敏试验结果来选择敏感的抗生素，以有效控制肺部感染，从而减轻心脏的负担。例如，痰培养提示有肺炎链球菌感染，可能会选用针对该菌敏感的抗生素进行治疗。
抗凝相关药物
抗凝剂：对于肺心病伴有高凝状态的患者，可能会使用抗凝药物，如华法林。但使用华法林需要定期监测国际标准化比值（INR），将其控制在合适的范围内，以预防血栓形成，但用药过程中出血风险需要密切关注。