灰指甲常用的治疗药物有外用药物和口服药物。外用药物如阿莫罗芬搽剂，一般需要连续使用数月，大约3-6个月左右可能会有效果；口服药物常见的有伊曲康唑胶囊，通常采用冲击疗法，一个疗程大概需要几个月时间。
外用药物治疗
阿莫罗芬搽剂：它是局部外用抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后将搽剂均匀涂抹在病甲上，每周使用1-2次。不过，外用药物起效相对较慢，而且对于比较严重的灰指甲，单独使用外用药物效果可能不太理想。环吡酮胺乳膏：同样属于外用抗真菌药，能抑制真菌的生长。可以直接涂抹在病甲及周围皮肤，每天使用1-2次。但它的渗透作用相对有限，对于增厚严重的病甲，药物难以深入起到很好的治疗效果。
口服抗真菌药物
伊曲康唑胶囊：是一种合成的三氮唑类抗真菌药，作用机制是高度选择性干扰真菌的细胞色素P450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的合成。采用冲击疗法，即冲击治疗方案为每次200mg，每天2次，连用1周，停药3周为一个疗程，一般需要2-3个疗程。不过，使用伊曲康唑前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响。特比萘芬片：也是一种口服抗真菌药，能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，影响真菌细胞壁的麦角固醇的合成，从而发挥杀菌作用。一般成人剂量是每天250mg，连续服用6-12周，具体时间要根据病甲的生长情况来定。但同样，肝功能不全者要慎用。
治疗时的注意事项
指甲与趾甲的差异：指甲生长速度相对趾甲快，所以治疗趾甲灰指甲的时间通常比指甲灰指甲要长。一般指甲灰指甲可能需要3个月左右，而趾甲灰指甲可能需要6个月甚至更久。个人卫生方面：要保持足部和手部的清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、脚盆等物品，防止交叉感染。比如，夏天多汗时，要每天更换袜子，选择透气的鞋子。定期监测：无论是外用还是口服药物治疗，都要定期到医院复查，观察治疗效果以及药物对身体的影响。如果在用药过程中出现肝功能异常等不适症状，要及时告知医生。