急性肠炎通常可以通过多种检查方式来确诊，一般会先进行病史和症状询问，比如医生会问近期是否吃了不洁食物等情况。然后常见的检查有血常规检查，通过血常规可以看到白细胞等指标是否有异常，一般急性肠炎患者白细胞可能会有轻度升高。
粪便常规检查
粪便常规：可以观察粪便中是否有白细胞、红细胞、脓细胞等。如果有较多白细胞，提示可能存在肠道炎症。还能检查粪便中是否有寄生虫卵等，帮助排除感染性肠炎的其他病因。比如细菌性肠炎可能会在粪便常规中显示有较多白细胞。
病原学检查
细菌培养：如果怀疑是细菌感染引起的急性肠炎，会进行粪便细菌培养。一般需要将粪便样本送往实验室，培养出致病菌，就能明确是哪种细菌导致的肠炎，从而针对性治疗。比如培养出大肠杆菌等致病菌，就可以根据药敏试验选择合适的抗生素。病毒检测：对于病毒感染引起的急性肠炎，可通过粪便病毒检测来明确。像轮状病毒等，通过特定的检测方法能检测出是否存在相关病毒，帮助确定病因。
内镜检查
结肠镜检查：在一些情况下，医生可能会建议做结肠镜检查。虽然急性肠炎一般不需要首先做结肠镜，但如果病情不典型或者需要排除其他肠道疾病时会进行。结肠镜可以直接观察肠道黏膜的情况，看是否有充血、水肿、糜烂等表现。不过急性肠炎发作时肠道黏膜炎症明显，做结肠镜检查要谨慎操作，避免加重肠道损伤。