治疗灰指甲常用的药物主要有外用抗真菌药和口服抗真菌药。一般来说，口服抗真菌药如伊曲康唑等治疗效果相对较好，但具体还需根据病情等因素选择。
外用抗真菌药
阿莫罗芬搽剂：它是一种局部外用的抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用。每周使用1 - 2次即可，连续使用几个月可能会有较好效果。不过，它对于比较严重的灰指甲，单独使用可能起效相对慢一些。环吡酮胺乳膏：能抑制真菌细胞膜的合成，从而达到抗真菌的目的。可以直接涂抹在病甲部位，每天使用1 - 2次。但它的渗透力相对有限，对于增厚严重的病甲，可能难以深入发挥作用。
口服抗真菌药
伊曲康唑：属于唑类抗真菌药物，它可以干扰真菌细胞色素P450的活性，影响真菌细胞膜合成。采用冲击疗法，即吃一周停三周为一个疗程，一般需要2 - 3个疗程。它对多种真菌有较好的抑制作用，能有效治疗灰指甲，但需要注意肝功能等方面的监测，因为它可能会对肝脏有一定影响。特比萘芬：是丙烯胺类抗真菌药，能特异性抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌代谢。一般每天服用一次，连续服用几周，对于大部分灰指甲患者有较好疗效，同样也需要关注肝脏功能等情况，孕妇和哺乳期女性使用需要谨慎。
综合治疗注意事项
对于灰指甲患者，在用药的同时，还需要注意个人卫生，保持足部或手部的清洁干燥，避免与他人共用鞋袜、毛巾等物品，防止交叉感染。如果是患有糖尿病等基础疾病的患者，要积极控制基础疾病，因为这类人群灰指甲更容易反复发作且治疗相对复杂。另外，儿童患灰指甲时，使用口服抗真菌药需要非常谨慎，一般不建议轻易使用口服药，多考虑外用相对温和的药物，但也要在医生严格评估下进行。