肾痛主要原因有多种，其中较为常见的是肾结石，当结石在肾脏内移动时，可能会刺激肾盂或输尿管平滑肌，引发肾区的疼痛，这种疼痛通常比较剧烈，呈绞痛样。
一、肾脏疾病相关
1. 肾小球肾炎： 多种原因可导致肾小球肾炎，比如感染因素，像链球菌感染后，机体产生免疫反应，损伤肾小球，引发炎症。患者除了肾痛外，还可能出现蛋白尿、血尿、水肿等表现，蛋白尿可能会使尿液中泡沫增多，水肿常见于眼睑、下肢等部位。2. 肾盂肾炎： 主要是细菌感染引起，致病菌由尿道上行入膀胱，继而沿输尿管向上蔓延至肾脏，引起肾盂肾炎。急性肾盂肾炎患者会有高热、寒战，同时伴有肾区疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状；慢性肾盂肾炎可能会反复发作，肾痛症状相对较轻，但会影响肾脏功能，导致肾功能逐渐减退。
二、肾脏周围组织病变
1. 肾周围炎和肾周围脓肿： 多由体内其他部位的感染灶经血行播散到肾周围组织引起。肾周围炎如果没有及时控制，可能会发展为肾周围脓肿。患者会出现肾区疼痛，疼痛可向腰部、腹部放射，同时伴有发热、乏力等全身症状，发热体温可高达39℃以上。2. 肾梗死： 通常是由于肾动脉主干或分支栓塞导致肾脏组织缺血坏死。常见于有心房颤动、动脉粥样硬化等基础疾病的患者。患者会突然出现剧烈的肾区疼痛，还可能伴有血尿、高血压等表现，血压可能会升高到160/100mmHg以上。
三、其他原因
1. 肾囊肿： 单纯性肾囊肿较为常见，一般是肾脏出现单个或多个囊性病变。当囊肿较大时，可能会牵拉肾包膜，引起肾痛，这种疼痛多为隐痛或胀痛。如果囊肿发生感染或出血，疼痛会加剧，可能还会伴有发热等症状。2. 腰部肌肉劳损： 长期从事重体力劳动、久坐、久站等人群容易出现腰部肌肉劳损，也可能会导致肾区附近的肌肉牵涉痛，疼痛通常在劳累后加重，休息后可缓解，疼痛性质多为酸痛。