毛囊炎主要是由细菌等病原体感染引起的。比如金黄色葡萄球菌就很容易引发毛囊炎，大约50%的毛囊炎是由金黄色葡萄球菌导致的。
细菌感染引发
金黄色葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌是常见的引发毛囊炎的细菌。这种细菌容易在皮肤有破损、油脂分泌旺盛的部位滋生繁殖。比如，当皮肤因为搔抓、摩擦等原因出现微小破损时，金黄色葡萄球菌就可能趁机侵入毛囊，引起毛囊的炎症反应。表皮葡萄球菌感染： 表皮葡萄球菌也会导致毛囊炎。它在正常皮肤表面就可能存在，当皮肤的防御功能下降时，表皮葡萄球菌就会活跃起来，引发毛囊发炎。
皮肤卫生状况不佳
油脂分泌过多： 有些人皮脂腺分泌旺盛，比如青春期的青少年，皮脂腺分泌大量油脂，如果不及时清洁皮肤，油脂就会堵塞毛囊口，为细菌的滋生创造条件，从而增加毛囊炎的发生风险。一般来说，青春期少年油脂分泌比其他年龄段相对更旺盛，更易受此影响。清洁不彻底： 长期不洗澡或者洗澡时清洁不到位，皮肤表面的污垢、油脂等会越积越多，容易堵塞毛囊，使得毛囊周围的细菌容易繁殖，引发毛囊炎。
机体免疫力低下
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的免疫力会受到影响，白细胞的杀菌功能也会下降，这样就更容易受到细菌的侵袭，引发毛囊炎。据统计，糖尿病患者发生毛囊炎的概率比正常人要高2 - 3倍。长期使用免疫抑制剂者： 像一些器官移植术后需要长期使用免疫抑制剂的患者，他们的机体免疫力处于较低的状态，皮肤的防御功能减弱，细菌等病原体就容易感染毛囊，导致毛囊炎的发生。