眼部扁平疣有物理治疗、药物治疗和手术治疗等去除方法。
一、物理治疗：
眼部扁平疣一般由HPV感染引发，这是常见的病毒性皮肤病，可通过直接或间接接触传播。采用激光或冷冻等物理手段，能够使皮损脱落从而实现去除的目的。比如激光治疗，利用激光的能量精准地作用于扁平疣皮损处，将其破坏；冷冻治疗则是通过低温使扁平疣组织坏死、脱落。
二、药物治疗：
需遵医嘱使用水杨酸软膏、维A酸乳膏、他扎罗汀凝胶等药物。水杨酸软膏可以起到软化和剥脱角质的作用，有助于扁平疣的去除；维A酸乳膏和他扎罗汀凝胶能调节皮肤角化，对扁平疣有一定的疗效。
三、手术治疗：
当病情较为严重时，可通过手术切除来进行治疗，以达到治愈效果。手术能较为直接地将扁平疣病灶去除。
在治疗期间，要格外注重眼部的清洁卫生，避免发生继发感染，同时要按照规定定期到医院复查，以便及时了解病情变化和治疗效果。
总之，对于眼部扁平疣的治疗，应根据具体情况选择合适的方法，并注意治疗过程中的相关事项。